answer from Bluehost: <br>&quot;Simple Scripts could overwrite your .htaccess during an upgrade, however
 Simplescripts doesn&#39;t modify any files in an upgrade unless Drupal has 
outlined that the files should be changed, so any files other than the 
.htaccess that were modified would be a result of Drupal specifying that
 they should be.&quot;<br><br>I will spend the whole weekend trying to set up my localhost and connection to server. <br>Thanks Earnie. <br><br><div class="gmail_quote">On Fri, May 18, 2012 at 1:09 PM, Anthony <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:tony@tony-mac.com" target="_blank">tony@tony-mac.com</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Will check. Thanks. Going crazy here at work with other issues.<br>I checked aliases in the individual nodes and one had the whole long &quot;<a href="http://foo/bar/q=" target="_blank">http://foo/bar/q=</a> ...&quot; in it bit the others seem ok. Is that what you meant? I also deleted and recreated the 2 menu links which are still defective. <br>
<div class="HOEnZb"><div class="h5">
<br><div class="gmail_quote">On Fri, May 18, 2012 at 4:32 AM, Earnie Boyd <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:earnie@users.sourceforge.net" target="_blank">earnie@users.sourceforge.net</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">

<div>On Thu, May 17, 2012 at 8:51 PM, Anthony &lt;<a href="mailto:tony@tony-mac.com" target="_blank">tony@tony-mac.com</a>&gt; wrote:<br>
&gt;<br>
&gt; Now all is working except for 2 links on the main menu.<br>
&gt; These two get switched to /foo/bar/bar/pagename1 instead of<br>
&gt; /foo/bar/pagename2.<br>
&gt; I can call up the pages with /node/nr. The main menu links look ok though<br>
&gt; there was garbage in some. the full url and then some, of the pages. Wht<br>
&gt; could be causing this extra bar?<br>
<br>
</div>Maybe a symptom of your earlier issues.  Possibly a cron execution<br>
updated them incorrectly.  No one but you has eyes on it so it is hard<br>
to say.  Check the url aliases in the admin ui, are they still good?<br>
<div><div><br>
--<br>
Earnie<br>
-- <a href="https://sites.google.com/site/earnieboyd" target="_blank">https://sites.google.com/site/earnieboyd</a><br>
--<br>
[ Drupal support list | <a href="http://lists.drupal.org/" target="_blank">http://lists.drupal.org/</a> ]<br>
</div></div></blockquote></div><br><br clear="all"><br></div></div><span class="HOEnZb"><font color="#888888">-- <br><p><b style="font-size:13px;font-family:&#39;Lucida Handwriting&#39;,cursive"><i>Anthony Stefan Maciejowski</i></b></p>
<p></p>
<br><p></p><br>
</font></span></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br><p><b style="font-family:&#39;Lucida Handwriting&#39;,cursive;font-size:13px;background-color:rgb(255,255,255)"><i>Anthony Stefan Maciejowski</i></b></p><p>
</p><br><p></p><br>